漆黑的魅影当然是最为成功的一部改版作品之一。优点很多，主要修改的亮点有以下几点：
先说一下，这个游戏拥有所有386改版的优点（关于这一点可以参看我的这个回答：口袋妖怪绿宝石386的386是什么意思? - 疯癫的A兵者的回答），即在这个游戏中仅凭单机、无需通信、活动以及电影，单纯通过游戏中可以得到的装备和升级的方式获得全部口袋妖怪，这极大程度上满足收集控的爱好，作为口袋妖怪爱好者的最大群体，收集控对这个游戏可以收服全图鉴以及所有神兽最为满意。
除此之外，漆黑的魅影还有以下很多386版本没有的优点：
从主线设置上面：
漆黑的魅影设置了三个周目，采用了三个平行的世界观，相互关联。游戏以一种倒叙和插叙相结合的方式进行，一周目在主角的回忆中，而二三周目则是在主角在苏醒之后进行剧情。剧情推进上面依靠主角的意识恢复以及反派的计划不断展开的方式，一定程度上面弥补了正作上剧情推动力的不足，同时加入很多神兽剧情，使得主线剧情比较饱满。
从游戏上面，有着很多非常好的改进：
（1）漆黑的魅影中利用宝石版本的地图，加以修改，增设了许多特殊场景。
一般改版，侧重精灵出现以及分布的修改，而修改地图很少。漆黑的魅影修改非常成功，一方面没有翻天覆地的更改，然而每个新增场景都曲径通幽，别有洞天，极大地丰富了游戏场景和内容。比如游戏后期很多隐藏场景以及每个城市以及神兽新增的场所。场景的设置也和神兽属性相互呼应，比如在火焰近路设置捕获炎帝的场景，在无人发电站设置捕获雷公的场景等等，比较合理。
（火焰近路中，添加的收服炎帝的场景）
（2）另一个是剧情的修改，这是本作最大亮点之一。
漆黑的魅影从很大程度上改变了口袋妖怪游戏剧情性不够的短板，每个城市新增场景中都有非常丰富得剧情添加。同时，这些添加的很多剧情都是与口袋妖怪TV版呼应，新增的神兽剧情完全与口袋妖怪的剧场版一致（比如《冰空的花束谢依米》《七夜的许愿星基拉祈》），口袋迷玩起来非常痛快。另外，还加入了一些原创剧情和反派人物，使得剧情上丰富很多。一周目坂木和火箭队加上二周目中的银河团和等离子团，构成了庞大的故事脉络。
（银河团，火箭队，等离子团等反派悉数登场，同时很多反派人物角色形象也与动画和正作中相近，同时原创了主线剧情，涉及到三个不同世界，故事脉络展开得非常得当）
（3）还有一个亮点是突破了图鉴的限制。本作使用的是第三世代的模型和地图，图鉴上限是386，而漆黑的魅影主版精灵是索罗亚库，来自于黑白版本。另外，鬼龙、谢依米、珍珠兽、钻石兽、卢卡里奥等等都是下一世代登场的精灵。这种跨时代的设计，很容易满足玩家对于图鉴和精灵的需求，围绕这些新世代的精灵的剧情，也与最新的电影或动画相近，更为令人快乐。
（二周目的剧情围绕着梦世界展开，里面涉及到了大量四世代和五世代的精灵，比如酋雷姆）
（4）更为关键的是还添加大量人物以及相关人物关系。
在这部中，添加了许多原先版本没有的人物，很多人物却是来源于耳熟能详的动漫中活跃人物，玩起来可以与众多著名训练师交手、合作双打不仅仅使得世界观宏大不少，而且也能使看过动漫的玩家玩起来有更为真实的体验感。除了火箭队三人组这样的反派之外，第一世代的小刚、小霞等道馆训练师，后面的艾莉丝等等都悉数登场，和主角或对战或成为队友。
（电视动画中著名的火箭队三人组在游戏的一周目中作为“人格代码”被植入，成为最大反派之一）
（5）电脑AI以及对战系统的优化。
在这部改版中，电脑AI的变化还是挺明显的，玩过对战的同学都知道正作的AI有多低，几乎没有成熟的招式组合和配合，无脑打基本通关问题不大，漆黑的魅影到中期以后还是可以看到一些AI的进步，尽管打起来还是很容易，后期挑战各种大BOSS、人物，等级很多70+，战斗中还是需要一些技巧的，这种适度的挑战性还是给了游戏很好的体验，尤其是入坑时间较长的玩家。
（不仅仅是BOSS技能等级有所增加，其他方面也有改进，很多时候在正作中无脑平A的打法在这个改版中并不能很顺利地通关）
（6）神兽的设置与抓捕改进
在这部改版中，神兽设置与抓捕相对于386版本有很大改进。神兽问题感觉是《漆黑的魅影》处理最好的问题之一。历代正作，都是属于神兽根本无法集齐的情况；而在普通的386版本中，则是神兽遍地，失去了神秘感，同时物以稀为贵，遍地神兽也使得收服神兽失去了成就感。在这一点上面《漆黑的魅影》做的是很用心的，既保证玩家可以捕捉不同世代中的所有神兽，尽量给神兽单独的剧情，即使没有神兽剧情的神兽，也会单独设置场景，同时神兽也是地图上唯一存在的，给予玩家收服神兽时必要的成就感。
个人观点，如有不妥之处求轻喷，欢迎口袋爱好者一起讨论~
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